Философские размышления об AIСпровоцированы они
письмом Нубара Афеяна, основателя фонда Flagship и всем известной компании Moderna. Он рассуждает о том, что наше понимание intelligence (интеллекта) – слишком человеческое, и приводит в пример еще два интеллекта: природный и искусственный. По его мнению, настала пора объединить эти три интеллекта в poly-intelligence, чтобы они черпали друг у друга и взаимно обогащались (в качестве раннего примера он приводит Леонардо да Винчи, который размышлял над объединением природы, техники, искусства и человеческого разума).
Мне всегда занимала загадка сознания, отличия живого от неживого, способность живого моделировать реальность и адаптироваться к ней. С этой точки зрения вирусы, конечно, живые. Обладают ли они своего рода intelligence, зашитым в ДНК? Вопрос определений, то есть не предмет для спора, с моей точки зрения.
Далее Нубар упоминает компанию
Generate Biomedicines (c которой мы не раз общались). Их платформа совмещает машинное обучение с получением экспериментальных данных (все самые модные слова – криоэлектронная микроскопия, микрофлюидика, бесклеточные системы экспрессии, ДНК-библиотеки). В итоге они утверждают, что порождают антитела и другие белки, в том числе совсем новые, невиданные в природе. Сейчас они в первой фазе по астме, результаты клиники скоро будут опубликованы. Компания собрала более $700M финансирования, стоит больше $2B.
Еще один
амбициозный AI-проект, уже не относящийся к Flagship, – построение модели целой клетки с помощью AI. Пока что в статье рассказывается о планах: требованиях к модели и данным, способах валидации, и, конечно, об открывающихся перспективах – разработка новых лекарств, клеточных терапий, вплоть до создания «цифрового двойника» человека. Авторы пишут, что одних данных о последовательностях биополимеров
в тысячу раз больше, чем данных, на которых тренировали ChatGPT, не говоря уже о данных других модальностей, что внушает им надежду на успех.
И, наконец, интересная
статья о приложении AI к получению новых белковых структур. Авторы
опубликовали модель ESM3, с помощью которой получили новую форму белка GFP (зеленый флуоресцирующий белок, очень интересный объект: образование флуоресцентного в нем происходит после сворачивания белка путем химической реакции между аминокислотными остатками внутри белковой структуры; GFP придают свечение медузам и широко используются в биотехнологии). Такие белки редко возникали в ходе эволюции – видимо, даже для природы это экзотика. Ученые начали с остатков в ядре GFP и в итоге получили флуоресцирующий белок, совпадающий с GFP всего на 58%, что по их подсчетам соответствует
эволюционной дистанции в 500 млн лет. Они оговариваются, что это, конечно, не симуляция настоящей эволюции, потому что языковая модель не подвергалась эволюционному процессу. Однако они продемонстрировали важную способность порождать белки за пределами пространства «естественных» структур.
