У каждого своя отмена Болонской системы. На Физтехе так:
Болонский процесс
Болонская система – лишь договоренность о взаимном признании дипломов. Система уровней бакалавриат + магистратура остается.
Вступительные в магистратуру
На данный момент ГОСы не учитываются при поступлении в магистратуру другой ФШ. В дальнейшем планируется вообще отменить систему поступления в магистратуру через ГОСы и сделать отдельные вступительные экзамены.
https://t.center/pravovoyprofkom/158
Учитывая, что ректор Физтеха сам бывший министр - можете не сомневаться, что оно так и будет.