هرچند منطقۀ خودمختار گورنو-بدخشان (GBAO) به دلیل جایگاه ترانزیتی و منابع طبیعی در مرکز منافع ژئوپلیتیک قدرتهای جهانی قرار دارد اما تنش بین مردم منطقه و دولت تاجیکستان و ترانزیت مواد مخدر و تروریسم به دلیل توسعهنیافتگی سبب بیثباتی این منطقه شده است.