Про филиалы организаций был такой документ: Письмо Минобрнауки России от 06.12.2023 N МН-3/10782 "О работе диссертационных советов"   В соответствии с пунктом 16 Положения о присуждении ученых степеней, утвержденного Постановлением Правительства от 24 сентября 2023 г. N 842, организация, где выполнялась диссертация, дает заключение по диссертации, которое подписывается руководителем или по его поручению уполномоченным заместителем руководителя организации. Сообщается, что заключение обособленного структурного подразделения юридического лица не может быть принято в составе документов, направляемых в диссертационный совет, так как данное подразделение организацией не является. Обособленное структурное подразделение также не может быть назначено и в качестве ведущей организации по диссертации.